Option Biologie

UE 1.1 Approches fondamentales - 12 ECTS

Cette UE disciplinaire fondamentale vise à fournir aux étudiants une compréhension approfondie des grands mécanismes cellulaires et moléculaires qui structurent le fonctionnement du vivant. À travers l’étude de la croissance, du vieillissement et de la mort cellulaire, de l’organisation et des fonctions des membranes biologiques, du maintien de l’intégrité du génome et de la régulation de l’expression génique — incluant les mécanismes épigénétiques — ainsi que des voies de signalisation et de la régulation du métabolisme cellulaire, cette UE apporte un socle de connaissances essentiel en biologie cellulaire et moléculaire.

Elle permet aux étudiants de consolider leurs bases théoriques, de mieux comprendre les processus biologiques normaux et pathologiques, et de préciser ou conforter leur choix de spécialité au sein des parcours de la formation.

Enseignements obligatoires : 5 enseignements

• EC1 Croissance, vieillissement et mort cellulaire (30h CM)
• EC2 Organisation et fonction des membranes biologiques (30h CM)
• EC3 Maintien de l'intégrité du génome et régulation génique (30h CM)
• EC4 Régulation épigénétique et mise en place de programmes géniques (30h CM)
• EC5 Signalisation et régulation du métabolisme cellulaire (30h CM)

UE 3.1 Méthodes d'analyses et technologies avancées en biologie - 9 ECTS

Cette UE a pour objectif d’introduire les étudiants aux grandes approches méthodologiques et technologiques de la biologie-santé, en lien direct avec les enseignements disciplinaires du second semestre et les pratiques de recherche en laboratoire. Elle propose un ensemble d’enseignements constitutifs (EC) couvrant des domaines clés tels que les technologies des neurosciences, le génie génétique et les outils moléculaires, la modélisation des pathologies humaines, la bioinformatique, ou encore l’analyse structurale des biomolécules et l’imagerie.

L’étudiant choisit 3 EC parmi ceux proposés, en cohérence avec son projet de formation et de recherche. Ce choix lui permet d’acquérir des bases théoriques ciblées et une compréhension approfondie des principes méthodologiques du domaine sélectionné, compétences essentielles pour aborder les enseignements du second semestre et pour maîtriser les techniques qu’il mettra en œuvre lors de son stage.

5 enseignements constitutifs (3 choix parmi 5) – chaque EC valide 3 ECTS

• EC1 Technologies des neurosciences (14h CM/ 13h TD) (pdf, 208 ko) 
• EC2 Génie génétique, outils moléculaires (14h CM/ 13h TD) (pdf, 200 ko) 
• EC3 Modélisation des pathologies humaines (14h CM/ 13h TD) (pdf, 178 ko) 
• EC4 Bioinformatique (14h CM/ 13h TD) (pdf, 200 ko) 
• EC5 Analyse structurale des biomolécules et imagerie (14h CM/ 13h TD) (pdf, 200 ko) 

Mise à jour 23/02/26

UE 3.2 Initiation à la recherche - 3 ECTS (16H CM / 8h TD)

Cette UE prépare les étudiants à une entrée réussie dans le monde de la recherche. Elle les accompagne dans la construction de leur projet personnel et leur donne les clés pour comprendre l’organisation et le fonctionnement de la recherche (EPST, universités, agences de financement, valorisation, etc.). Les étudiants y acquièrent également les fondamentaux pour conduire un projet de recherche : recherche documentaire, cadre réglementaire, questions d’éthique, ainsi que les méthodes de rédaction d’un rapport structuré sur le modèle d’un article scientifique. Enfin, une présentation des principaux métiers de la recherche permet à chacun d’identifier clairement les rôles et interactions au sein d’un laboratoire avant son arrivée en stage.

Enseignement obligatoire : valide 3 ECTS

UE 3.3 Ateliers technologiques (1 SAE au choix) - 3 ECTS (26h TP / 4h TD)

Cette UE est conçue sous la forme d’une Situation d’Apprentissage et d’Évaluation (SAÉ) visant à immerger l’étudiant dans des conditions proches de la recherche en laboratoire. Elle permet la découverte et l’acquisition des techniques couramment utilisées dans le domaine de spécialisation choisi par l’étudiant, à travers un large panel d’expérimentations réalisées sur une période concentrée. L’étudiant est placé en situation active de mise en œuvre des méthodes expérimentales, d’analyse des résultats et de réflexion critique sur les approches utilisées, compétences qui sont évaluées tout au long de la SAÉ.

Enseignement à choix :  4 enseignements constitutifs (1 choix parmi 4) – 1 EC valide 3 ECTS

• SAE1 Biologie des cellules cancéreuses (pdf, 294 ko) 
• SAE2 Exploration du métabolisme cellulaire
• SAE3 Electrophysiologie animale et humaine pour les neurosciences (pdf, 202 ko) 
• SAE4 Activation dynamique des cellules immunitaires (pdf, 294 ko) 

Mise à jour 23/02/26

UE 5.1 Anglais scientifique I - 3 ECTS (24h TD)

Cette UE vise à renforcer les compétences de communication écrite et orale en anglais des étudiants en biologie, dans un contexte directement ancré dans les pratiques scientifiques. Les étudiants y développent des stratégies efficaces pour comprendre, rédiger et présenter des données scientifiques en anglais de spécialité (biologie cellulaire, génétique, physiologie, neurosciences, etc.). L’enseignement, entièrement dispensé en anglais, est assuré conjointement par des enseignants de langue et des enseignants-chercheurs, afin d’offrir une formation au plus près des exigences et des usages du métier de biologiste. Cette approche permet aux étudiants de consolider à la fois leur anglais courant et leur anglais scientifique, compétences essentielles pour la poursuite d’études, la recherche et plus largement les carrières scientifiques en biologie.

Enseignement obligatoire : valide 3 ECTS

UEPE 2.1 Les maladies décryptées : Regards physiopathologiques - 3 ECTS (1EC au choix, 30h CM/TD)
Cette UE est dispensée au département de médecine en commun avec les étudiants de med2/med3

Cette UE Projet Personnel de l'étudiant a pour objectif d’apporter aux étudiants une compréhension solide des mécanismes de physiopathologie impliqués dans les grandes maladies humaines. Elle permet de relier les connaissances fondamentales en biologie aux manifestations cliniques des pathologies, en mettant l’accent sur les altérations des fonctions physiologiques et leurs conséquences à l’échelle de l’organisme. Dispensée au département de médecine par des praticiens hospitaliers, cette UE s’appuie sur l’étude de cas cliniques et de situations médicales concrètes, offrant ainsi aux étudiants une immersion au plus près de la réalité du terrain et des pratiques hospitalières. Cette approche favorise une vision intégrée des maladies, du diagnostic à la prise en charge thérapeutique. Cette UE s’articule étroitement avec l’UE 2.2, qui aborde les mêmes grandes pathologies sous un angle complémentaire, centré sur les mécanismes moléculaires et cellulaires. Ensemble, ces deux enseignements offrent une lecture cohérente et multi-échelles des maladies, allant de la biologie fondamentale à ses applications médicales.

Enseignement à choix : 4 enseignements constitutifs (1 choix parmi 4) – chaque EC valide 3 ECTS

• EC1 Diabètes et complications cardiométaboliques (30h CM/TD)
• EC2 Physiopathologie des maladies immunitaires (30h CM/TD)
• EC3 Cancer de la biologie à la pratique médicale (30h CM/TD)
• EC4 Neurosciences affectives : émotion (30h CM/TD)

UE 2.2 Approches translationnelles des pathologies - 12 ECTS

Cette UE a pour objectif d’approfondir la compréhension des grandes pathologies humaines en s’intéressant aux mécanismes moléculaires, cellulaires et tissulaires qui sous-tendent leur développement et leur évolution. Ces enseignements mettent en lumière les voies de signalisation, les mécanismes de régulation et les dysfonctionnements biologiques impliqués dans les états pathologiques.

Chaque grande pathologie est abordée de manière cohérente à travers un binôme de deux enseignements constitutifs (EC) indissociables, permettant une analyse approfondie et complémentaire du thème choisi. À ces deux EC s’ajoute un troisième EC, sélectionné dans un autre champ pathologique, afin de favoriser une ouverture disciplinaire ou la personnalisation du projet professionnel de l’étudiant.

Enseignement à choix :  8 enseignements constitutifs (3 choix parmi 8) – chaque EC valide 4 ECTS

• EC1 Les pathologies cardio-métaboliques (18h CM/18h TD)
• EC2 Mécanismes de régulation et troubles de l'homéostasie énergétique (18h CM/18h TD)
• EC3 Biologie des cellules cancéreuses (18h CM/18h TD)
• EC4 Régulation génique et cancer (18h CM/18h TD)
• EC5 Human neuroscience in health and pathology (18h CM/18h TD)
• EC6 Neurosciences moléculaires et plasticité synaptique (18h CM/18h TD)
• EC7 Relation Hôtes/Microorganismes (18h CM/18h TD)
• EC8 Immunologie et immunopathologie (18h CM/18h TD)

UE 2.3 Concepts transversaux en pathologies - 6 ECTS

Cette UE a pour objectif d’explorer de grands mécanismes biologiques transversaux dont les dysfonctionnements sont impliqués de manière récurrente dans de nombreuses pathologies humaines. Elle met en évidence les processus communs qui relient des maladies d’origines et de manifestations cliniques diverses, en dépassant une approche strictement centrée sur une pathologie unique.

Quelle que soit l’orientation ou les préférences thématiques des étudiants, cette UE propose une vision intégrée et fédératrice des quatre grands champs pathologiques développés au sein de l’enseignement. Elle permet ainsi à chacun d’acquérir des connaissances transversales essentielles, favorisant une compréhension globale des maladies et constituant un socle commun indispensable pour la poursuite d’études, la recherche ou les applications biomédicales.

Enseignement à choix :  6 enseignements constitutifs (2 choix parmi 6) – chaque EC valide 3 ECTS

• EC1 Glycopathologies (14h CM/13h TD)
• EC2 Aspects moléculaires des pathologies humaines (14h CM/13h TD)
• EC3 Metabolic plasticity in health and diseases (14h CM/13h TD)
• EC4 Maladies génétiques humaines (14h CM/13h TD)
• EC5 Homéostasie musculaire (14h CM/13h TD)
• EC6 Canaux ioniques dans les pathologies humaines (14h CM/13h TD)

UE 4.1 Stage d'initiation à la recherche - 6 ECTS

Cette UE a pour ambition de plonger les étudiants au cœur de la réalité de la recherche en biologie et santé. Grâce à une immersion totale au sein d’un laboratoire de recherche, les étudiants découvrent concrètement le fonctionnement d’une équipe scientifique, ses méthodes de travail, ses contraintes et ses enjeux, leur permettant ainsi d’affiner et de conforter leur projet professionnel.

Intégrés à un projet de recherche, les étudiants participent activement aux expérimentations, à l’analyse des résultats et à la réflexion scientifique qui les accompagne. Cette expérience se conclut par la rédaction d’un mémoire présentant le contexte, les objectifs et les résultats du travail réalisé, que l’étudiant soutiendra devant un jury, dans des conditions proches de celles du monde académique et professionnel.

Stage obligatoire :  6 semaines en laboratoire (France ou étranger)

UE 5.2 Anglais scientifique II - 3ECTS  (24h TD)

Cette UE s’inscrit dans la continuité de l’anglais scientifique du premier semestre et vise à approfondir et professionnaliser les compétences de communication en anglais des étudiants en biologie. Elle met l’accent sur les usages avancés de l’anglais dans les contextes académiques et professionnels, en préparant les étudiants aux situations concrètes du métier de biologiste.